জেল ইলেক্ট্রোফোরিয়সিসের সাহায্যে উপাদানটি পৃথক করার পর ডিএনএকে কল্পনা এবং ফটোগ্রাফ করার জন্য বিভিন্ন ধরনের দাগ রয়েছে। অনেকগুলি পছন্দসইগুলির মধ্যে, এই পাঁচটি স্ট্রেনগুলি ইথিডিয়াম ব্রোমাইডের সাথে সর্বাধিক প্রচলিত প্রারম্ভিক, যা সর্বাধিক ব্যবহৃত হয়। এই প্রক্রিয়ার সঙ্গে কাজ করার সময়, এটি শুধুমাত্র স্ট্রেনের মধ্যে পার্থক্যগুলি না থাকা গুরুত্বপূর্ণ কিন্তু অন্তর্নিহিত স্বাস্থ্যের ঝুঁকিগুলি।
01 এথিডিয়াম ব্রোমাইড
এডিডিয়াম ব্রোমাইডটি সম্ভবত ডিএনএ দেখার জন্য সবচেয়ে সুপরিচিত ছোপানো। এই ছোপানো জেল মিশ্রণ ব্যবহার করা যাবে, ইলেক্ট্রোফোরিসিস বাফার মধ্যে বা এটি চালানো পরে জেল দাগ। ডাই এর অণুগুলি ডিভিএর strands এবং UV আলো অধীন ফ্লোরসেসের মাপদণ্ড, আপনি ঠিক দেখাচ্ছে যেখানে ব্যান্ডগুলি জেলের মধ্যে অবস্থিত। তার সুবিধা সত্ত্বেও, নেতিবাচক দিক হল যে ethidium ব্রোমাইড একটি সম্ভাব্য ক্যান্সারেনজেন, তাই এটি মহান যত্ন সঙ্গে পরিচালনা করা আবশ্যক। এই জেলের সাথে কাজ করার সম্ভাব্য স্বাস্থ্য ঝুঁকির কারণে বিকল্পগুলি পাওয়া গেছে। 02 SYBR গোল্ড
SYBR গোল্ড ডাই ডবল বা একক-বিভক্ত ডিএনএ, অথবা RNA দাগ করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। বাজারে আঘাত করার জন্য এসিডিয়াম ব্রোমাইডের প্রথম বিকল্পের মধ্যে SYBR গোল্ড ছিল এবং এটি ethidium bromide থেকে বেশি সংবেদনশীল বলে মনে করা হয়। এটি নিউক্লিক এসিডের সাথে আবদ্ধ হওয়ার পর ডাই 1000 গুণ বেশি ইউভি তরল প্রদর্শন করে। এটি তারপর পুরু এবং উচ্চ শতাংশ Agarose gels penetrates এবং ফর্মালডিহাইড gels ব্যবহার করা যেতে পারে। যেহেতু অবাঞ্ছিত অণুটির প্রতিপ্রভ এত কম, তবে তা প্রয়োজনীয় নয়। লাইসেন্সধারার আণবিক অনুসন্ধানগুলি (SYBR গোল্ড লঞ্চ) থেকে উন্নত এবং বাজারজাত SYBR নিরাপদ এবং SYBR সবুজ যা ethidium bromide নিরাপদ বিকল্প আছে।
03 সিআরবিআর গ্রীন
SYBR সবুজ ও দ্বিতীয় দাগ (আবার, আণবিক probes দ্বারা বাজারে) বিভিন্ন উদ্দেশ্যে অপ্টিমাইজ করা হয়। যেহেতু তারা ডিএনএ-তে আবদ্ধ, তাই তারা এখনও সম্ভাব্য মিউট্যানগনকে বিবেচনা করে এবং এর ফলে তাদের যত্ন নেওয়া উচিত। SYBR সবুজ আমি দ্বি-বিভক্ত ডিএনএ সঙ্গে ব্যবহারের জন্য বেশি সংবেদনশীল, অন্যদিকে, SYBR সবুজ দ্বিতীয়, একক-বিভক্ত ডিএনএ বা আরএনএ সঙ্গে ব্যবহারের জন্য সেরা। জনপ্রিয় এথিডিয়াম ব্রোমাইড দাগের মতো, এই অত্যন্ত সংবেদনশীল স্টুডিও ইউভি লাইটের আওতায়। 04 সিআরবিআর নিরাপদ
এসিডিয়াম ব্রোমাইড এবং অন্যান্য SYBR স্টেনগুলির একটি নিরাপদ বিকল্প হতে সিআরবিআর সেফ ডিজাইন করা হয়েছিল। এটি একটি বিপজ্জনক বর্জ্য বলে মনে করা হয় না এবং সাধারণত নিয়মিত সিয়ার সিস্টেমের (যেমন ড্রেন নিচে) মাধ্যমে নিষ্পত্তি করা হয়, কারণ বিষাক্ত পরীক্ষার ইঙ্গিত দেয় যে কোন তীব্র বিষাক্ততা নেই। পরীক্ষাটি ইঙ্গিত দেয় যে সিরিয়ার হামেস্ট ভ্রূণ (এসএইচ) কোষ, মানুষের লিম্ফোসাইট, মাউস লিম্ফোমা কোষ এবং এমএমএস পরীক্ষায় সামান্য বা কোন জেনোটক্সাইটিস নেই। দাগ একটি নীল-হালকা ট্রান্সিলিউমিনেটর দিয়ে ব্যবহার করা যেতে পারে যা ডিএনএকে দৃশ্যমান করে কম ক্ষতি করে এবং পরে ক্লোনিংয়ের জন্য ভাল দক্ষতা প্রদান করে। 05 ইভা গ্রিন
ইভা গ্রিন হল একটি সবুজ ফ্লোরোসেন্ট রঞ্জক রং যা অন্য রংগুলির চেয়ে পিসিআরকে কম পরিমাণে আটকানো হয়েছে। এই পরিমাণগত বাস্তব সময় PCR মত অ্যাপ্লিকেশন জন্য এটা খুব দরকারী করে তোলে। এটি ডিএনএর পুনরুদ্ধারের জন্য কম গলে গলে গলে ব্যবহার করা হলে এটি একটি ভাল পছন্দ। উচ্চ তাপমাত্রায় এটি খুব স্থিতিশীল এবং তার খুব কম স্বচ্ছতা রয়েছে, তবে ডিএনএতে আবদ্ধ হওয়ার পর এটি অত্যন্ত তরল। ইভা গ্রিনও খুব কম বা কোন সাইটোটক্সিসিটি বা মিউটেন্সিসিটি নির্ণয় করা হয়নি।