সুপেরিয়র পিসিআর ফলাফলগুলির জন্য কি প্রয়োজন তা খুঁজে বের করুন

পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশন (পি.সি.আর.) প্রতিক্রিয়াগুলির যে কোনো উপাদানগুলির সাথে সামঞ্জস্যের ফলে ফলাফলের গুণমান পরিবর্তন করা যায়, পণ্য উৎপাদনের গুণমানকে উন্নত বা হ্রাস করা বা প্রতিক্রিয়া বিশিষ্টতা এবং সংবেদনশীলতা উন্নত করে। শেষ ফলাফল প্রভাবিত যে পরামিতিগুলি শারীরিক (অর্থাৎ, তাপমাত্রা, চক্র বার) বা রাসায়নিক (অর্থাৎ, টেমপ্লেট নিবিড়তা, এনজাইম প্রকারের ধরনের) হতে পারে। PCR এর সাফল্যের উপর প্রভাব ফেলে এমন কয়েকটি গুরুত্বপূর্ণ বিষয়গুলি নিম্নোক্ত।

  • 01 পরিষ্কার ল্যাবরেটরি শর্তাবলী

    পিপকেট। © ফিলিপস, ২008।

    যেহেতু পিসিআরটি ডিএনএর একটি একক অণুর সন্ধান করতে সক্ষম তাই ল্যাবরেটরীতে প্রাথমিক অবস্থার বজায় রাখা গুরুত্বপূর্ণ। সবসময় তাজা গ্লাভস পরুন, জারিত কাচপাত্র, টিউব এবং pipette টিপস এবং নির্বীজ সমাধান ব্যবহার করুন, এবং কাজ শুরু করার আগে কাজের এলাকা পরিষ্কার।

    সর্বদা সঠিক প্রতিক্রিয়া অন্তর্ভুক্ত, টেমপ্লেট ডিএনএ ছাড়া এবং এনজাইম ছাড়া, ফলাফল সত্যিই সঠিক নমুনা বিবর্ধনের কারণে নিশ্চিত করতে।

    বেশিরভাগ লোকই তাদের নিজস্ব সেট সমাধান নিশ্চিত করে থাকেন যে সমস্যা সমাধান সহজে ভাগ না করা এবং মনোনীত pipettes প্রায়ই PCR- এর জন্য একপাশে রাখা হয়। DNase এবং RNase- মুক্ত PCR টিউব, এরিসোল-প্রতিরোধী pipette টিপস এবং UV আলো সঙ্গে একটি ধূমকেতু হুড কাজ করেও সমস্যা কমানোর উপায়।

  • 02 রাসায়নিক উপাদান

    সমালোচনামূলক গুরুত্ব এছাড়াও টেমপ্লেট বিশুদ্ধতা এবং সততা (শুদ্ধ ডিএনএ) এবং প্রাইমারের নকশা। প্রাইমারে ডিজাইন করার জন্য অনেকগুলি সফ্টওয়্যার প্রোগ্রাম অনলাইনে পাওয়া যায়। সেরা প্রাইমার্স:
    • 18 থেকে 24 ভিত্তি আছে
    • কোন দ্বিতীয় গঠন আছে (অর্থাত, hairpin loops)
    • জি / সি এবং এ / টি জোড়া সুষম বন্টন আছে
    • 3-ফুট শেষ পর্যন্ত একে অপরের পরিপূরক নয়
    • গলে যাওয়া তাপমাত্রা (টিএম) সম্পর্কে 5-10 ডিগ্রী সেলেসিয়াস নীচের তাপমাত্রা, যা সাধারণত 55 এবং 65 ডিগ্রি সেলসিয়াসের মধ্যে থাকে

    উভয় primers জন্য Tm এছাড়াও ভাল ফলাফলের জন্য অনুরূপ হওয়া উচিত।

  • 03 প্রতিক্রিয়া মিক্স: টেমপ্লেট এবং প্রাইমারস

    প্রতিক্রিয়া মিশ্রণের অনুপাত PCR ফলাফলের গুণমানের উপর বিশাল প্রভাব ফেলে। টেমপ্লেট, এনজাইম, প্রাইমার, এবং নিউক্লিওটাইডের সন্নিবেশের জন্য একটি সাধারণ সূত্র আছে, কিন্তু এটি একটু আলগা করা যেতে পারে।

    অনুকূল প্রাইমার ঘনত্ব 0.1 এবং 0.6 মাইক্রোমোলি / এল এর মধ্যে। টেমপ্লেট পরিমাণ ডিএনএ (মানব, ব্যাকটেরিয়া, প্লাজমড) এর ধরনের উপর নির্ভর করে পরিবর্তিত হয়।

    টেমপ্লেট খুব কম পরিমাণে, ফলাফল উন্নত করতে অন্যান্য কৌশল আছে, যেমন চাকা সংখ্যা বা "গরম শুরু" ব্যবহার। সর্বদা একটি ইতিবাচক নিয়ন্ত্রণ প্রতিক্রিয়া সঙ্গে নতুন প্রাইমার পরীক্ষা, তারা আপনার নির্দিষ্ট পরীক্ষামূলক অবস্থার অধীনে কাজ নিশ্চিত হতে।

  • 04 প্রতিক্রিয়া মিক্স: এনজাইম কার্যকলাপ

    ডিএনএ পলিমারেজের পছন্দ পণ্য প্রতিক্রিয়া এবং মানের বিশ্বস্ততা প্রভাবিত করে। ঐতিহ্যগত Taq পলিমারেজকে অনেকগুলি ল্যাবসে উচ্চতর বিশ্বস্ততা এনজাইম দ্বারা পরিবর্তিত করা হয়েছে (যারা কম ত্রুটি করে)।

    প্রতিক্রিয়া মিশ্রিত MgCl2 এর ঘনত্ব PCR ফলাফল প্রভাবিত করতে পারে এবং আরও দ্রুতগতিতে প্রতিক্রিয়াগুলির মধ্যে একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করতে পারে। ম্যাগনেসিয়াম cation পলিমেরেজ এনজাইম সনাক্ত করে যে প্রকৃত স্তর উত্পাদন করতে DNTPs সঙ্গে দ্রবণীয় কমপ্লেক্স ফর্ম।

    সমস্ত চারটি ডিএনটিপিগুলি সমান পরিমাণে পলিমেরেজ ত্রুটি হার কমাতে সাহায্য করে। বিটেইন, বিএসএ, ডিটারজেন্ট, ডিএমএসও, গ্লিসারোল, এবং পাইরোফসফ্যাটেজের মতো কিছু সংযোজনও এনজাইম নির্দিষ্টতা বা প্রতিক্রিয়ার কার্যকারিতা প্রভাবিত করতে পারে।

  • 05 থার্মোসি ক্ল্লারের ধরন

    থেরোমোসাইক্লার। © ফিলিপ্স, ২008।

    ল্যাবরেটরি সরঞ্জামের জন্য কেনাকাটা করার সময়, মনে রাখবেন যে কিছু তাপস্থল সঠিক, পছন্দসই তাপমাত্রা বজায় রাখতে অন্যান্য তুলনায় কম সুনির্দিষ্ট।

    এটি এমন একটি এলাকা যেখানে সস্তায় যাওয়া দীর্ঘ সময় ধরে বন্ধ হয় না যখন আপনি একটি চটকদার প্রতিক্রিয়া সম্মুখীন হয় বা primers ব্যবহার করে যা annealing তাপমাত্রা একটি সংকীর্ণ পরিসীমা প্রয়োজন

    আপনি ব্যবহার করছেন thermocycler সুনির্দিষ্ট ব্র্যান্ড মাপসই পরিকল্পিত পাতলা- walled প্রতিক্রিয়া টিউব, এছাড়াও অনুকূল প্রতিক্রিয়া তাপমাত্রা সাহায্য।

  • 06 সাইকল সেটিংস

    প্রতিক্রিয়া চক্র দৈর্ঘ্য, তাপমাত্রা, এবং অনেকগুলি চক্র, একটি পিসিআর কীভাবে কাজ করবে তা নির্ণয় করার জন্য সকলের একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রয়েছে। প্রারম্ভিক গরমের ধাপটি সম্পূর্ণরূপে সম্পূর্ণরূপে ছিন্ন করার জন্য যথেষ্ট হওয়া উচিত এবং চক্রটি দীর্ঘস্থায়ী ডিএনএকে পুনরায় চলাচল থেকে নিজেকে রক্ষা করতে যথেষ্ট হতে হবে।

    আরও টেমপ্লেট বাড়ানোর জন্য কম এনজাইম ক্ষতিপূরণ জন্য প্রতি 20 চক্র সম্পর্কে এক্সটেনশন সময় বৃদ্ধি দ্বারা বৃদ্ধি ফলিত করা সম্ভব। সাধারণত, 40 টিরও কম চক্র 10 টিরও কম টেমপ্লেট অণুকে এথিডিয়াম ব্রোমাইড-দাগযুক্ত agarose gel- তে দেখতে যথেষ্ট পরিমাণে একটি ঘনত্বের জন্য যথেষ্ট।